Шишкино — село на северо-западе района, в степном Крыму, высота над уровнем моря — 48 м. Соседние сёла: Воробьёво — в 3 км и Фурманово в 1 км на северо-восток, Абрикосовка в 2,5 км на юг и Приветное в 4,5 км на юго-запад. Расстояние до — Евпатории 20 километров. Транспортное сообщение осуществляется по региональной автодороге . В селе действуют сельская библиотека, фельдшерско-акушерский пункт. . Шишкино связано автобусным сообщением с Евпаторией и соседними сёлами.